Прототипы второй фазы отличались перенесенными на 40 мм вперед стойками лобового стекла, что облегчило доступ в салон. Среди других новшеств — уменьшение количества «дворников» с трех до двух, дверные ручки под естественный хват, иная форма крышек подъемных фар. Было построено по крайней мере пять машин, две из которых впоследствии переоборудовали в кабриолеты для съемок в фильме о Джеймсе Бонде "Живешь только дважды" (You Only Live Twice).
Автомобиль был разработан совместно с Yamaha Motor Corporation. По данным компаний Toyota и Yamaha, всего был изготовлен 351 автомобиль 2000GT (233 шт. - MF10s, 109 шт. - MF10Ls, 9 шт. - MF12Ls).
Для продвижения автомобиля на рынке США японцы выбрали гоночный путь. Чтобы быть уверенными в 100% успехе, они позвали самого знаменитого гонщика США Кэрролла Шелби для полноценной подготовки автомобиля к кузовным гонкам SCCA.
Сотрудничество было довольно простым: Toyota отправила в Калифорнию 3 автомобиля для гонок, компания Шелби адаптировала машины под регламент SCCA, а опытные гонщики команды Шелби помогали настраивать автомобиль.
WheelsAge.org '2005–actual